“请允许我代表高性能计算项目组对你们的支持和无私帮助道一声诚挚的感谢。”在这个特殊的新春里,上海超算中心收到了一份特殊的感谢信:甘肃省计算中心高性能计算组赞赏上海超算科技HPC plus 平台和技术人员的协同努力,只需6个小时,就建立了多地互联互通的合作研究机制;只用了16小时,就上线了大量CPU和GPU的免费计算资源,服务于正在进行的一线科学研究。
在病毒疫苗和药物的研发过程中,先要对病毒进行基因测序,了解病毒的基本结构。超级计算机在基因测序、药物研发、病毒结构等方面可以发挥重要作用,加速研究进度。上海超级计算中心在历次突发公共卫生事件如SARS、禽流感等的药物研制中也发挥了重要作用。
1月30日晚,兰州大学和澳门科技大学中药质量研究国家重点实验室的科研团队通过甘肃省计算中心(上海超算甘肃分中心)与上海超算中心取得联系,希望可以提供计算资源和技术支持以满足即将开展的更大规模的计算模拟工作。双方沟通后得知,研究人员至少需要1000核CPU,30块以上invida V100GPU加速处理器,以及50TB的存储资源。了解情况后,上海超算通过HPCPlus平台迅速整合了超过3000核CPU和32块V100GPU的免费计算资源(分别由上海超算、甘肃超算和苏州超算中心共同提供)。
在上海超算中心主任周曦民的倡议和努力下,在此前的互联共享机制基础上,上海超算又联合甘肃省计算中心、江西省计算中心、苏州超算中心、昆山超算中心共建互联互通合作研究机制于2月1日向社会宣布,将统筹协调大规模CPU和GPU资源免费提供给广大科研人员开展疫苗研发、药物筛选等抗击疫情相关研究工作,与时间赛跑,为生命护航。
上海超算中心相关工作人员告诉记者,面对此次疫情,研究工作者需要弄清楚什么样的分子可以和病毒结合,使病毒失去功能。通过超级计算机模拟不同的药物分子与病毒结合后发生的变化,可以极大的加速这一过程。
新民晚报记者 马亚宁
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