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基因鉴定监测病毒变异趋势 信息技术实现快速申报 沪大数据技术赋能防疫精准有序

来源:新民晚报     记者:马亚宁     作者:马亚宁     编辑:易蓉     2020-02-14 09:21 | |

确诊新冠病毒之后,是否隔离到位及时拦截了病毒传播,能否知晓病毒变异趋势,为药物和疫苗研发指明方向……面对病毒肆虐,我们努力从跟着病毒“追跑”,变为抢先病毒“领跑”。在此过程中,大数据技术正在助我们跑出“加速度”。今天上午,拥有大数据特长的上海科技创新资源数据中心,在线面向全国医疗机构、医生和医学研究者提供推出一项免费服务:提供病毒基因组测序鉴定服务。这一服务能够帮助医院和医生绕到病毒背后一看究竟,为临床诊断和治疗提供参考,为全面分析研究病患的呼吸道病毒组、研究其致病因子提供支撑。

大数据支撑病毒基因组鉴定

在当下疫情防控的攻坚阶段,精准的基因组测序对每一位病患及奋战在抗疫一线的医务工作者来说,都是有效、及时进行诊疗的重要依据。上海科技创新资源数据中心利用自身的大数据和云计算平台发挥技术特长,第一时间联合中国科学院上海巴斯德研究所、中国科学院上海营养与健康研究所,共同研发了基于二代测序数据的病毒基因组鉴定服务。

“根据病患的呼吸道样本二代测序数据,通过分析流程将样本数据与病毒基因库进行快速比对,3小时便可检测出包括SARS、COVID-19等在内的所有人类已知基因组的病毒。”中心战略部科学数据产品经理左天宇告诉记者,病毒基因组鉴定与核酸检查相比,优势在于不仅可精准识别病毒基因特性,还能监测病毒变异趋势并及时做出更新判定。

“希望病毒基因组鉴定所形成的鉴定分析结果能帮助更多的医院、医生进行临床诊断和治疗提供参考,同时为疫情防控、疾病诊治、药物筛选、疫苗设计与药物研发和对病毒朔源、变异进化、致病机理等研究工作提供重要支撑。”上海科技创新资源数据中心CTO张嘉锐说。

大数据与病毒“殊死赛跑”

疫情发生以来,在看不见摸不着的数据空间里,无数微不足道的“比特”汇聚而成大数据,与病毒展开了“殊死赛跑”。1月28日,在“一网通办”总门户、“随申办”APP、“随申办”小程序同步上线“一网通办”新型肺炎防控专栏。目前共接入相关服务事项25个,其中包括:来沪人员健康登记、确诊患者涉及区域及场所查询、网上问诊、发热门诊医疗机构查询等热门服务。截至2月12日,“一网通办”各渠道防控专栏访问量累计已超119.4万次,其中移动端各渠道累计访问量超过117.6万次。

疫情防控关键期,减少人员跑动和集聚,要让数据多跑路。根据疫情防控指挥部的安排,上海市大数据中心开发的“企业复工人员网上登记系统”和“解除医学措施查询系统”也于昨天上线。用户利用电脑或手机,通过“一网通办”总门户、“随申办”APP、“随申办”两个小程序或者健康云平台、进入新冠肺炎防控专栏,选择“解除医学措施查询”服务,输入姓名、身份证号,即可查询到医学观察措施和结束时间。

据上海市大数据中心主任朱宗尧介绍,“企业复工人员网上登记系统”依托本市大数据资源平台,对接健康云平台数据,通过数据赋能,提供员工返沪日期、员工是否为风险人员信息等,实现了一次填报、多次复用。特别对于用工人员较多的企业,还开发了二维码,员工可以通过扫码,由系统自动采集信息,系统自动汇总上报,最大限度降低企业填报负担,为企业加强疫情防控,合理安排复工复产提供支撑。

新民晚报记者 马亚宁

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